Βασική διαφορά: Οι Σιίτες είναι μία από τις δύο μεγάλες αιρέσεις του Ισλάμ, ενώ η άλλη είναι οι Σουνίτες. Το Ismaili είναι μια διαίρεση μέσα στη σέτα των Σιτών. Η διαίρεση οφείλεται στην επιλογή ενός ιμάμη.
Πριν καταλάβετε πώς κατανέμονται οι Shias σε αυτούς τους τρεις κλάδους, είναι σημαντικό να κατανοήσετε πώς σχηματίστηκαν οι διαφορές μεταξύ των Σουνιτών και των Σιτών. Κάτω από τον Μωάμεθ, όλοι οι μουσουλμάνοι θεωρούνταν ως ένα. Ο Μωάμεθ θεωρείται ως ο τελευταίος προφήτης του Θεού. Οι διαφορές ακολούθησαν τον θάνατο του Μωάμεθ. Ο Μωάμεθ πέθανε χωρίς να δηλώσει επισήμως έναν κληρονόμο να ηγηθεί της μουσουλμανικής κοινότητας. Υπήρχαν δύο κύριοι διεκδικητές: ο Abu Bakr (ο πεθερός του Μωάμεθ) και ο Αλή (ξάδελφος του Μωάμεθ και γαμπρός του). Ο Σουνιτικός διάλεξε τον Αμπού Μπακρ, ο οποίος ήταν φίλος και έμπιστος του Μωάμεθ ως Χαλίφη για να οδηγήσει και να συμβουλεύει. Ωστόσο, οι Σιίτες πιστεύουν ότι ο Χαλιφάτος πρέπει να παραμείνει στην οικογένεια του Μωάμεθ και ως εκ τούτου προτιμούσε τον Αλί ως ηγέτη. Ο Αλί έγινε ο τέταρτος χαλιφάτος υπό τη σουνική κυριαρχία. Εκτός από αυτά, υπάρχουν και άλλες μικρές διαφορές ως προς τον τρόπο με τον οποίο προσεύχονται και τι πιστεύουν. Λόγω αυτών των διαφορών μεταξύ των Σιιτών και των Σουνιτών, υπήρξε συνεχής σύγκρουση μεταξύ των δύο αιρέσεων του Ισλάμ.
Οι Σιίτες αντιμετώπισαν επίσης κάποιες εσωτερικές διαφωνίες σχετικά με τους ιμάμηδες και ποιος θα πρέπει να οδηγήσει ως ιμάμη. Κάτω από το Shia Islam, ένας Ιμάμης θεωρείται ηγέτης που θεωρείται ως καθοδηγητής για όλες τις πτυχές της ζωής. Σύμφωνα με το δόγμα των Σιτών, το Ιμάμα είναι θεϊκός θεσμός που διαδέχθηκε τον θεσμό της Προφητείας. Πιστεύουν ότι οι ιμάμηδες επιλέγονται και συλλέγονται από τα θεία όντα, έχουν πλήρη γνώση και μπορούν να ερμηνεύσουν σωστά το Κουράν. Τώρα, η διαφορά μεταξύ των Σιιτών διαφέρει λόγω της επιλογής των Ιμάμηδων. Ο Ισμαηλί είναι ένας κλάδος του Σιιτικού Ισλάμ που ονομάζεται μετά τον Ισμαήλ ιβν Ιαφάρ, που πιστεύουν ότι είναι ο σωστά διορισμένος Ιμάμ ή πνευματικός διάδοχος. Αυτό διαφέρει από τους Twelvers που πιστεύουν ότι ο Mūsà al-Kāzim, ο μικρότερος αδελφός του Ismail, είναι ο αληθινός ιμάμης.
Ο Ισμαλιτισμός, σε ένα σημείο ήταν ο μεγαλύτερος κλάδος του Σισίμ που βρισκόταν σε πολιτική εξουσία κατά τον δέκατο και δωδέκατο αιώνα. Δεδομένου ότι ο Ισλαμισμός είναι κλάδος και μέρος των Σιών, και οι δύο μοιράζονται πολλές πεποιθήσεις, συμπεριλαμβανομένου ότι υπάρχει μόνο ένας αληθινός Θεός και ότι οι Ιμάμες πρέπει να είναι απόγονοι του Μωάμεθ μέσω της κόρης του Φατίμα. Τόσο ο Σίς όσο και ο Ισμαήλ πιστεύουν ότι η οικογένεια του Μωάμεθ (Ahl al-Bayt) ως θεϊκά επιλεγμένη, αλάθητη και καθοδηγούμενη από τον Θεό να ηγηθεί της ισλαμικής κοινότητας.
Το Nizari Ismaili είναι ένα μονοπάτι (tariqah) του Shia Islam, με έμφαση στην κοινωνική δικαιοσύνη, τον πλουραλισμό και την ανθρώπινη λογική στο πλαίσιο της μυστικιστικής παράδοσης του Ισλάμ. Θεωρείται ως ο δεύτερος μεγαλύτερος κλάδος του Ισλάμ και αποτελεί την πλειοψηφία του Ismaili. Το Mustaali Ismaili είναι μια αίρεση του Ismaili Shia Islam. Η κύρια διαφορά μεταξύ του Nizari Ismaili και του Mustaali Ismaili είναι ποιος θα έπρεπε να είχε οδηγήσει ως ο Ιμάμης. Ο Nizaris δέχθηκε τον Imam Nizar (τον πρώτο) ως το δέκατο ένατο Ιμάμ, ενώ οι Mustaalis θεωρούν τον μικρότερο αδελφό του Nizar Mustali. Οι μουσουλμάνοι Nizari διευθύνονται επί του παρόντος από τον Aga Khan IV, ο οποίος είναι γνωστός ως Imam Shah Karim.
Σύμφωνα με τη Wikipedia, "Οι Μουσταίλιγια αναφέρονται επίσης ως Ταϊάμπι ή Ṭayyibī, μετά τον τελευταίο Ιμάμ τον οποίο αναγνωρίζουν, Ṭayyib Abī l-Qāσim. Ιστορικά, υπήρξε μια διάκριση μεταξύ της Ṭayyibiyyah και της Ḥāfiziyyah, η οποία αναγνώρισε τους Φατιμίνους ηγέτες της Αιγύπτου (μεταξύ 1130-1169) ως νόμιμους ιμάμους και όχι τον Ṭayyib Abī l-Qāσim. Η άποψη του Hafizi έχασε κάθε στήριξη μετά την πτώση της δυναστείας των Φατιμίδων: οι σημερινοί Μουσταίλιγια είναι όλοι Ṭayyibiyyah. Ο μεγαλύτερος όμιλος Mustaali είναι ο Bohra και ο μεγαλύτερος όμιλος Bohra είναι ο Dawoodi Bohra, ο οποίος βρίσκεται κυρίως στην Ινδία. Το όνομα Bohra είναι μια νέα ερμηνεία της λέξης vahaurau της Γκουτζαράτι ("to trade"). Οι άνθρωποι του Bohrα αποτελούνται από δύο κύριες ομάδες: μια πλειοψηφία εμπορικών τάξεων Shi'i και μια μειονότητα Sunnī που είναι κυρίως αγροτικοί αγρότες ".
Οι Σιίτες και οι Ισμαηλί είναι αρκετά παρόμοιες στις πεποιθήσεις και τις κουλτούρες τους, καθώς οι Ισμαλίες είναι μέρος της σέτικης σίτισης. Όλες οι αιρέσεις μοιράζονται την ίδια πίστη για τον Αλλάχ και τον Μωάμεθ. Ο Αλλάχ πιστεύεται στον έναν και τον αληθινό Θεό, με τον Μωάμεθ να είναι ο τελευταίος προφήτης του Θεού.