Βασική διαφορά: Ένα στοιχείο είναι μια καθαρή χημική ουσία που έχει έναν ή έναν τύπο ατόμου, που διακρίνεται από τον ατομικό του αριθμό. Υπάρχουν συνολικά 118 στοιχεία τα οποία έχουν αναγνωριστεί, τα οποία διακρίνονται μεταξύ μετάλλων, μεταλλοειδών και μη-μετάλλων. Κάθε στοιχείο έχει το δικό του σύνολο ιδιοτήτων. Τα άτομα είναι οι βασικές μονάδες από τις οποίες αποτελείται όλη η ύλη. Κάθε άτομο έχει ένα μοναδικό όνομα, μάζα και μέγεθος. Οι διαφορετικοί τύποι ατόμων ονομάζονται στοιχεία.

Ένα στοιχείο είναι μια καθαρή χημική ουσία που έχει έναν ή έναν τύπο ατόμου, που διακρίνεται από τον ατομικό του αριθμό. Ο ατομικός αριθμός προέρχεται από τον αριθμό των πρωτονίων που υπάρχουν στον πυρήνα του στοιχείου. Υπάρχουν συνολικά 118 στοιχεία τα οποία έχουν αναγνωριστεί, τα οποία διακρίνονται μεταξύ μετάλλων, μεταλλοειδών και μη-μετάλλων. Κάθε στοιχείο έχει το δικό του σύνολο ιδιοτήτων. Τα περισσότερα στοιχεία είναι διαθέσιμα στη γη, ενώ μερικά έχουν αναπτυχθεί τεχνητά μέσω πυρηνικών αντιδράσεων. Ένα στοιχείο είναι ήδη στην πιο ακατέργαστη μορφή του και δεν μπορεί να αναλυθεί περαιτέρω. Όλα τα στοιχεία μπορούν να βρεθούν στον Περιοδικό Πίνακα, με ατομικό αριθμό.
Τα άτομα είναι οι βασικές μονάδες από τις οποίες αποτελείται όλη η ύλη. Τα άτομα είναι μικροσκοπικά, κυμαίνονται από 0, 1 έως 0, 5 νανόμετρα σε πλάτος. Είναι τόσο μικροσκοπικά που δεν μπορούν καν να τις δουν σε ένα μικροσκόπιο. Υπάρχουν πολλοί τύποι ατόμων. Κάθε άτομο έχει ένα μοναδικό όνομα, μάζα και μέγεθος. Οι διαφορετικοί τύποι ατόμων ονομάζονται στοιχεία.
Ουσιαστικά, το άτομο είναι μια μονάδα ενώ τα στοιχεία είναι συγκεκριμένες ουσίες. Ένα άτομο είναι η μικρότερη δυνατή μονάδα αυτού του στοιχείου που διατηρεί τις ιδιότητες αυτού του στοιχείου. Για παράδειγμα: Το σίδηρο (Fe) είναι ένα στοιχείο. Ένα μπλοκ σιδήρου μπορεί να διασπαστεί σε νιφάδες σιδήρου, το οποίο μπορεί στη συνέχεια να διασπαστεί σε άτομα. Το άτομο θα εξακολουθεί να εμφανίζει όλες τις ιδιότητες του σιδήρου, συμπεριλαμβανομένου του μαγνητισμού.

Ο αριθμός των πρωτονίων, των νετρονίων και των ηλεκτρονίων σε ένα άτομο καθορίζει ποιο στοιχείο είναι. Για παράδειγμα: Ένα άτομο σιδήρου έχει 26 πρωτόνια, 30 νετρόνια και 26 ηλεκτρόνια. Κάθε άτομο σιδήρου θα έχει αυτή τη διαμόρφωση.
Τα στοιχεία είναι τα βασικά δομικά στοιχεία για όλους τους τύπους ουσιών. Μπορούν να συνδυαστούν μεταξύ τους για να σχηματίσουν μόρια. Τα άτομα διαφορετικών στοιχείων συγκεντρώνονται για να παράγουν μόρια. Αυτό συμβαίνει μέσω μιας χημικής αντίδρασης. Για παράδειγμα: δύο άτομα υδρογόνου και ένα άτομο οξυγόνου συνδυάζονται για να δημιουργήσουν ένα μόριο νερού.